מבקר המדינה, השופט בדימוס מיכה לינדנשטראוס, גילה חשד לעבירות פליליות במשרד התחבורה בתקופת כהונתו של אביגדור ליברמן כשר במשרד, וגם לאחר שכבר פרש מתפקידו. מדובר במינויים שנעשו לכאורה בניגוד לחוק תוך העדפות פסולות מסיבות אישיות וזרות ומסיבות פוליטיות. ככל הידוע, המבקר עומד להעביר בקרוב מידע זה לידי היועץ המשפטי לממשלה

המידע המחשיד את ליברמן התחדד לאחרונה בעקבות מידע חדש שהובא לידי משרד מבקר המדינה. מהמידע עולה, כי לחברה החדשה שהוקמה במקום מעצ (שפעלה כיחידת סמך) הועדפו מקורבים משיקולים זרים. עשרות מינויים בוצעו שלא כדין, ותופעה זו נמשכה גם לאחר יוני 2004 לאחר שליברמן סיים את תפקידו כשר התחבורה. מתברר, כי אנשיו של ליברמן, שכבר "ישבו" בחברה, המשיכו לסדר למקורבי ליברמן תפקידים בכירים. מהכיבודים נהנו פעילים בכירים בישראל ביתנו וגם מקורבים לחברי מרכז הליכוד, בעלי זיקה לליברמן

כמה דוגמאות שהוצגו על ידי אותם גורמים, בפני מבקר המדינה: בוריס אברמוב מונה לתפקיד ממונה מסירת עבודות. אברמוב הינו שכנו של ליברמן ופעיל בכיר במפלגת ישראל ביתנו. על-פי המידע שהועבר למבקר, מונה אברמוב מתוך שיקול זר ובהליך בלתי תקין

עו"ד סימה לוי, בתו של השר לשעבר דוד לוי, מונתה לתפקיד רכז משפטים, למרות שלא היה לה ניסיון קודם בתחום זה. על פי המידע שהובא ל-Nfc, בן זוגה של לוי הינו פעיל בכיר בקבוצה המקורבת לליברמן